Cintia,
Durante la creación de un artículo en Libertya, se generan varias entradas adicionales además del registro en M_Product. Entre las entradas que seguramente te están faltando podemos contar las traducciones del producto (M_Product_Trl) y el arbol de productos (AD_TreeNodePR).
En tu proceso de importación manual, deberías realizar generar también dichos registros; o bien realizar la importación utilizando/ampliando las importaciones de Libertya, las cuales permiten utilizar el modelo, y de esta manera delegar a éste la generación de dichas entradas.
Saludos,
Federico