Buenas,

Tal como comentás; en el Libertya.properties que genera la aplicación con información de conexión a bbdd, login de usuario, almacén, etc. se almacena también este dato bajo la clave UILookFeel.

Este archivo lo encontrás en el directorio personal del usuario logueado al sistema operativo:

Windows: Documents & Settings / usuarioXXX
Linux: home / usuarioXXX

Saludos!