En Libertya existe el concepto de 2do y 3er esquema contable, pero sinceramente, es una funcionalidad heredada de los sistemas desde los que se inició Libertya y no ha sido verificada, por lo cual no podemos asegurar que funcione al 100% o que haya que hacer alguna configuración adicional / Codificación para poder utilizarla. Esta funcionalidad permitiría contabilidar en 2 o 3 contabilidades separadas las mismas transacciones.
Por otro lado, lo que mencionas en el 2do punto es la posibilidad de crear 2 compañias. Eso se puede hacer habilitando el usuario System. Si buscas en el Foro, esto ya ha sido contestado con anterioridad. Luego de crear una segunda compañia, ésta aparecerá en la pantalla de login ademas de la que viene creada por defecto para poder elegirla.

Saludos
Antonio