Estimado,
La solucion es simple: Deberías crear un articulo de tipo Gasto, asociar a ese articulo la cuenta contable que necesitas y luego usarlo en la factura.
Ahora, si lo que necesitas es que un mismo articulo se contabilice en 2 cuentas diferentes dependiendo de si se paga con un subsidio o no…. ya es otro tema y mas bien deberías asociar la CxP a ese subsidio en vez del gasto.
Espero haber sido de ayuda
Saludos
Antonio