Hola,
Para utilizar la funcionalidad de factura electrónica que ofrece pyafipws desde Libertya no es necesario registrar el servidor COM; sólo es necesario tener instaladas las dependencias de Python (M2Crypto, httplib2 y pysimplesoap), el módulo pertinente (estimo que wsfev1.py) y el módulo wsaa.py.
Además, deberías seguir el instructivo que contiene los pasos previos necesarios para que todo funcione.
Saludos,
Juan Manuel.