Buenas,
Lo importante es que esas facturas no generen saldos incorrectos en LY, por ejemplo para las entidades comerciales.
Lo ideal seria que se anulen dichas facturas, siempre apuntando a homologación a fin de “lleva a cero” las cuentas.
En cuanto a la numeración, LY delega la misma al número recibido por parte de AFIP. Por lo tanto cuando pases el punto de venta a producción y emitas una factura, la secuencia se actualizará con el valor indicado por AFIP.
Una vez pasado a producción, se recomienda que si es necesario realizar pruebas, se hagan con la emisión de facturas con un monto pequeño.